Τα Αλώνια είναι ένα μικρό παραδοσιακό χωριό της Σαμοθράκης που απέχει μόλις 3 χιλιόμετρα από τη Χώρα, την πρωτεύουσα του νησιού. Έχει πολλά πέτρινα σπίτια με κεραμοσκεπές και περιβάλλεται από ένα καταπράσινο τοπίο με διάφορα είδη φυτών και δέντρων, όπως άγριες βελανιδιές, ελιές, ροδιές, μουριές και λυγαριές.
Το όνομά του οφείλεται στα πολλά στρέμματα περιβολιών που το περιβάλλουν. Μάλιστα, μέχρι τη και δεκαετία του ’60 κάθε σπίτι είχε το δικό του αλώνι, όπου κατά τους καλοκαιρινούς μήνες αποθηκευόταν το σιτάρι, το κριθάρι, το σουσάμι σε μεγάλες θυμωνιές για να αλωνιστεί ο καρπός με μουλάρια ή άλογα που έσερναν πίσω τους το αρκάνι, ένα χειροποίητο εργαλείο που χρησιμοποιούσαν γι’ αυτόν το σκοπό. Δυστυχώς, σήμερα έχει διασωθεί ένα μόνο αλώνι το οποίο βρίσκεται στο Μετόχι της Μονής Ιβήρων, του Αγίου Αθανασίου, στις παρυφές του χωριού. Εκεί, γίνεται στις 18 Ιανουαρίου προς τιμήν του Αγίου Αθανασίου το μεγάλο πανηγύρι των Αλωνιών.
Στην παραλία των Αλωνιών υπάρχει αλιευτικό καταφύγιο. Πολύ κοντά στο χωριό βρίσκεται το στρατόπεδο του νησιού.